一场天灾浩劫笼罩着大地，紫魔兰在人类居住的山谷快速蔓延，带来无尽的死亡与毁灭。只有花千谷，在花神树的守护下暂时幸免于难，唯一受到紫魔兰影响的是由神兽凤凰带来的婴儿，被毒浸的孩子名为牡丹公主。国王和王后违背祖训，收留了牡丹公主，为她取名，抚养她成人。突如其来的花神树凋谢，牡丹公主也沉入疾病之中，引发花千谷人心惶惶，请求将牡丹公主送走。
王后为了拯救女儿，毅然向花神树求助，她自愿舍身进入黑色结界历经考验，企图唤回失落的花魂。但紫魔兰的力量太过庞大，王后被困其中，而绝望的呼唤也变得杳无音信。十年后，牡丹公主成年，紫魔兰再度侵袭花千谷，带来前所未有的劫难。牡丹公主怀着王后的教诲，带着唯一的希望——花魂种子，踏上了拯救花千谷的危险旅程。她坚信只有战胜紫魔兰，才能重现花千谷的昔日繁荣和和平。
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